Forklart: Fem trinn for å oppdage koronaviruset (COVID-19)
Prosessen ble forklart til The Indian Express av Dr V Ravi, seniorprofessor og leder, Institutt for nevrovirologi, NIMHANS.
Falsk blod er sett i reagensrør merket med koronaviruset (COVID-19) i denne illustrasjonen tatt 17. mars 2020. (Reuters) Dr V Ravi, seniorprofessor og leder, avdeling for nevrovirologi, NIMHANS, forklarer prosessen med å oppdage koronaviruset til denne nettsiden . Her er de fem trinnene:
Innsamling og transport
Testsenteret tar vattpinner fra nesehulene og baksiden av svelget (svelget), og legger prøver i et virustransportmedium, som inneholder balanserte salter og albumin for å forhindre at viruset går i oppløsning. Prøven transporteres deretter i kjølelager til testlaboratoriet.
Ekstraksjon av viralt RNA
Koronavirus som SARS-CoV (som dukket opp i Kina i 2002-03), MERS-CoV (som dukket opp i Saudi-Arabia i 2012), eller den nåværende SARS-CoV-2 som har forårsaket COVID-19-pandemien, har store , enkeltstrengede RNA-genomer. Testlaboratoriet trekker ut RNA fra prøvene ved å bruke kommersielt tilgjengelige sett (som de laget av selskaper som QIAGEN.)
Sette RNA i PCR-blandingen
cheri oteri nettoverdi
Ekstrahert RNA tilsettes til en blanding av polymerasekjedereaksjon (PCR). Dette inkluderer 'masterblandingen', som inneholder et 'revers transkriptase'-enzym som omdanner RNA til DNA. Mastermix inneholder Taq-polymerase, enzymet som lager kopier av DNA, nukleotider, samt andre elementer som magnesium - et ion som er nødvendig for å amplifisere DNA.
hvor mye er kunal nayyar verdt
PCR-blandingen inneholder også 'reagenser' som 'primere' og 'prober'. Primere er spesielle DNA-tråder som er designet for å binde seg til DNAet som skal kopieres; sonder brukes til å oppdage den spesifikke sekvensen i DNA-prøven. WHO har anbefalt spesifikke primere og prober for testing for COVID-19.
Til slutt består PCR-blandingen av et husholdningsgen - et normalt humant gen (RNase P) som brukes til å sikre at prøver ble samlet inn på riktig måte og RNA ekstrahert.
Amplifisering av viralt DNA
Prøven, i PCR-blandingen, legges i rør eller plater, som deretter settes i en termisk syklusmaskin som brukes til å utføre PCR-prosessen.
Først blir RNA omdannet til DNA. Så starter prosessen med å kopiere genene. Den termiske sykluseren varmer opp og avkjøler blandingen med prøven, alternerende mellom tre temperaturer - for å smelte DNA for å skille de to strengene, for at primeren skal binde seg til DNA, og for å syntetisere en ny streng - alt innenfor en syklus som varer i en minutt. Den termiske syklusen kjører 30-40 slike sykluser for å forsterke DNA for å se etter viruset.
Testing mot kontroller
Amplifisert DNA testes mot en positiv kontroll, som vanligvis består av gener fra viruset klonet inn i plasmid, og en negativ kontroll, som er en «kjent» prøve som har testet negativt for viruset tidligere.
RNase P skal vise forsterkning, positiv kontroll skal være positiv, negativ kontroll skal være negativ, og uansett hvilket resultat du får for prøven, er det riktige resultatet, sa nevrovirolog Dr V Ravi. For at en test skal være gyldig før resultatet frigis, må visse 'gyldighetskriterier' være oppfylt.
Ikke gå glipp av Explained | Hvordan COVID-19-testen fungerer
Hvis husholdningsgenet (RNase P) er positivt, positiv kontroll er positiv, negativ kontroll er negativ, og prøven ikke viser noe PCR-positivt resultat, blir prøven erklært negativ for SARS-CoV-2-virus-RNA. Hvis PCR-resultatet er positivt, har pasienten COVID-19.
Del Med Vennene Dine:
christopher rich nettoverdi
