Forklart: Hvor raskt sprer den nye koronavirusstammen seg? Vil det påvirke vaksinasjonen?

Ny koronavirusstamme i Storbritannia: India og flere andre land har suspendert flyvninger til og fra Storbritannia. Hvilke mutasjoner har ført til koronavirusvarianten som har skapt bekymring? Hvor raskt har det spredt seg? Og vil det påvirke vaksinasjon?

Flyreiser fra Storbritannia er kansellert på Cointrin flyplass, i Genève, Sveits, 21. desember 2020. (Reuters Foto: Denis Balibouse)

På mandag India suspendert alle flyvninger fra og til Storbritannia frem til 31. desember, midt i bekymringer om en ny variant av SARS-CoV-2 som sprer seg og vokser raskt der. Flere andre land har også suspendert britiske flyreiser og innført reiserestriksjoner.

Hva er disse bekymringene som fører til reiserestriksjoner?

Forrige uke ble den nye SARS-CoV-2-varianten avslørt for å være årsaken bak den raske økningen i Covid-19-tilfeller i Sør- og Øst-England. Det blir referert til som VUI (Variant Under Investigation) 202012/01, eller B.1.1.7-linjen.

I løpet av de siste dagene, takket være vår genomiske evne i verdensklasse, har vi identifisert en ny variant av koronaviruset, som kan være assosiert med den raskere spredningen i Sør-England, sa Storbritannias helseminister Matt Hancock til House of Commons den 14. desember Britiske myndigheter har allerede varslet Verdens helseorganisasjon om varianten.

Public Health England (PHE) kunngjorde at 1108 tilfeller med denne varianten er identifisert per 13. desember, hovedsakelig i Sør- og Øst-England. PHE jobber med partnere for å undersøke og planlegger å dele funnene i løpet av de neste 2 ukene, heter det.

Howard Cosell Bio

Hvordan er varianten?

Varianten ble identifisert i genomisk overvåking av COVID-19 Genomics UK (COG-UK), et konsortium som analyserer genomsekvenseringsdata fra Storbritannia. COG-UK er den største bidragsyteren til den globale Covid-19-databasen GISAID.

Varianten er resultatet av flere mutasjoner i piggproteinet til det nye koronaviruset SARS-CoV-2, samt mutasjoner i andre genomiske regioner av RNA-viruset. Foreløpig analyse tyder på at det er mer overførbart enn tidligere sirkulerende varianter. COG-UK identifiserte en av disse mutasjonene som N501Y, i et område av piggproteinet som binder seg til et nøkkelprotein i den menneskelige cellen, ACE2-reseptoren. Dette var en indikasjon på at endringene teoretisk sett kan føre til at viruset blir mer smittsomt. Det pågår forsøk på å bekrefte hvorvidt noen av disse mutasjonene bidrar til økt overføring, sa konsortiet.

Hva vet vi så langt om overførbarhet og alvorlighetsgrad av sykdom?

Søndag sa PHE at data fra helgenomsekvensering, epidemiologi og modellering antyder at den nye varianten overføres lettere enn andre stammer.

Imidlertid understreket den også at det ikke er bevis for at varianten er mer sannsynlig å forårsake alvorlig sykdom eller dødelighet. … Men vi fortsetter etterforskningen for å forstå dette bedre, heter det. Den sa at dødeligheten er en etterslepende indikator, og den vil kontinuerlig overvåke dette i løpet av de kommende ukene.

PHE har sagt at de ennå ikke vet mekanismen for denne økningen i overføring. Vi vet at mutasjoner i piggproteinet, den delen av viruset som gjør det smittsomt, kan endre hvordan viruset samhandler med menneskelige celler, heter det.

Den sa at bevisene viser at infeksjonsrater i geografiske områder hvor denne spesielle stammen har sirkulert har økt raskere enn forventet, og modellbeviset har vist at denne varianten har en høyere overføringshastighet enn andre varianter i dagens sirkulasjon.

Ny koronavirusstamme i Storbritannia: En politimann dirigerer trafikken ved inngangen til den stengte fergeterminalen i Dover, England, mandag, etter at havnen i Dover ble stengt. (AP Photo)

Hvor stor bekymring er den høyere overførbarheten?

18. desember sa New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (NERVTAG), som gir råd til den britiske regjeringen om trusselen fra nye og fremvoksende luftveisvirus, at den nye varianten potensielt kan øke reproduksjonstallet for sykdommen med opptil 0,93 . Den sa at den har moderat tillit til at den nye varianten viser en betydelig økning i overførbarhet sammenlignet med andre varianter.

Ekspertorganet konkluderte imidlertid med at det foreløpig ikke er nok data til å trekke noen konklusjon om den underliggende mekanismen for økt overføringsevne, aldersfordelingen av tilfellene og sykdommens alvorlighetsgrad. Det har sagt at 4 dødsfall i rundt 1000 tilfeller er identifisert, men ytterligere arbeid er nødvendig for å sammenligne denne dødsraten med sammenlignbare datasett.

Plasseringen av mutasjonene i det reseptorbindende domenet til piggglykoproteinet øker muligheten for at denne varianten er antigenisk forskjellig fra tidligere varianter. Fire sannsynlige reinfeksjoner er identifisert blant 915 forsøkspersoner med denne varianten, men det er nødvendig med ytterligere arbeid for å sammenligne denne reinfeksjonsraten med sammenlignbare datasett, heter det.

Søndag sa en trusselvurdering publisert av European Center for Disease Prevention and Control at fylogenetisk analyse avslører at klyngen skiller seg med 29 nukleotidsubstitusjoner fra den opprinnelige Wuhan-stammen. Tre sekvenser fra Danmark og en fra Australia, fra prøver samlet i november 2020, klynger seg med den britiske varianten, noe som sannsynligvis indikerer at internasjonal spredning har skjedd, selv om omfanget fortsatt er ukjent, heter det.

Ny koronavirusstamme i Storbritannia: Port of Dover stenger da EU-land innfører et reiseforbud fra Storbritannia. (Reuters bilde)

Men har ikke viruset mutert før?

Når et virus replikerer og sirkulerer i en menneskelig befolkning, forekommer mutasjoner naturlig, med en hastighet på rundt en til to mutasjoner per måned i den globale fylogenien.

Faktisk, for SARS-CoV-2, sier COG-UK at det for tiden er rundt 4000 mutasjoner i piggproteinet. Varianten D614G var tidligere den dominerende stammen fordi den spredte seg veldig lett. En annen stamme som oppsto i spanske gårdsarbeidere, 20A. EU1, spredte seg raskt over hele Europa om sommeren.

mariah carey nettoverdi forbes

Det er vanskelig å forutsi om en gitt mutasjon er viktig når den først dukker opp, mot et bakteppe av den kontinuerlige fremveksten av nye mutasjoner. Å forstå deres betydning kan være mulig basert på eksperimentelt arbeid som viser en sammenheng mellom mutasjonen og en subtil endring i virusbiologien. Imidlertid vil det ta mye tid og krefter å teste effekten av mange tusen kombinasjoner av mutasjoner, sa COG-UK.

Vil det påvirke vaksineutvikling og respons?

Søndag sa britiske myndigheter at ytterligere laboratoriearbeid blir utført som en prioritet for å forstå dette. Det er foreløpig ingen bevis som tyder på at Pfizer-vaksinen ikke ville beskytte folk mot den nye stammen, sa PHE.

Del Med Vennene Dine: