Forklart: Hvilke Covid-19-varianter er i India, og forklarer de økningen?

Over 320 koronavirusprøver har blitt funnet å ha den britiske avstamningen i Punjab. Forklarer dette den siste økningen? Og hvor utbredt er Sør-Afrika og Brasil-variantene, foruten andre i India?

På et kjøpesenter i Pune (Express Photo: Ashish Kale, File)

Mer enn 320 koronavirusprøver fra Punjab er funnet å ha den britiske avstamningen , en referanse til en ny stamme av viruset som hadde dukket opp i Storbritannia i desember, med genetiske mutasjoner som har gjort det mulig å spre seg raskere. Dette er den mest utbredte forekomsten av den britiske varianten i den indiske befolkningen som er funnet hittil, og kan muligens forklare den raske økningen i tilfeller i Punjab de siste ukene.

Nyhetsbrev| Klikk for å få dagens beste forklaringer i innboksen din

Jeff foxworthy rikdom

En uttalelse fra regjeringen onsdag sa at 736 prøver fra hele landet så langt har blitt funnet å ha britisk avstamning. Bortsett fra disse ble 34 prøver funnet å ha den sørafrikanske avstamningen, og en hadde den brasilianske avstamningen. De sørafrikanske og brasilianske variantene er to andre dominerende koronavirusstammer som sirkulerer rundt i verden. De genetiske mutasjonene i disse to variantene gjør det mer sannsynlig at de slipper unna det menneskelige immunsystemet. Bekymringen er derfor at nåværende vaksiner kan være relativt mindre effektive mot dem, selv om dette fortsatt undersøkes.

Varianter i India

De britiske, brasilianske og sørafrikanske variantene er ikke de eneste som for tiden sirkulerer i den indiske befolkningen. Som enhver annen organisme, muterer koronaviruset hele tiden, med noen endringer i dens genetiske struktur i hver replikasjonssyklus. De fleste av disse mutasjonene er uten betydning, og endrer ikke den generelle naturen eller oppførselen til koronaviruset. Men noen få av dem, muligens én av tusenvis, kan introdusere viktige endringer, og hjelpe viruset til å tilpasse seg eller overleve bedre.

Under denne epidemien blir tre typer endringer overvåket - de som øker virusets evne til å spre seg raskere, de som forårsaker mer alvorlig sykdom hos den infiserte personen, og de som hjelper viruset med å unnslippe immunresponsen.

De britiske, brasilianske og sørafrikanske variantene er slike stammer. Hver av dem har nå sine egne familier, noe som betyr at det har vært mange påfølgende mutasjoner i disse, men med den opprinnelige definerende mutasjonen intakt. Disse tre variantfamiliene, eller avstamningene, er funnet i flere land, og er hovedsakelig ansvarlige for økningen i tilfeller i Europa og Brasil.

Foruten disse sirkulerer flere andre varianter i den indiske befolkningen, de som har oppsto lokalt samt andre som er tatt med av reisende fra utlandet. Men ingen av disse har blitt klassifisert som en variant av bekymring.

Covid-19-varianter oppdaget i India

UK Covid-19 variant og bekymringer

Forskere har hevdet at ingen av de tre 'bekymringsvariantene' - Storbritannia, brasilianske eller sørafrikanske - kan knyttes til den nåværende økningen i tilfeller i India. Deres prevalensnivå i samfunnet, per nå, er ikke så høyt at den nåværende økningen kan tilskrives dem.

Selv i Punjab, hvor 80 % av 400 analyserte prøver viste seg å være den britiske varianten, er det for tidlig å klandre den for den ekstraordinære økningen i tilfeller de siste ukene. Resultatene av genomsekvensering er avslørt nå, og en klinisk korrelasjon må gjøres for å vurdere om de er ansvarlige for økningen i tilfeller.

Som forskere har påpekt, hvis folk som er infisert med den britiske stammen i Punjab alle er reisende, eller deres direkte kontakter, kan hendelsene deres lett forklares, og er ikke for mye til bekymring. Men hvis det har blitt funnet hos mennesker i det bredere samfunnet også, er det fare for at det sprer seg til andre veldig raskt. Det vil også bety at prosedyrene for isolasjon og karantene som følges i staten, spesielt for reisende, ikke har blitt fulgt strengt.

hvor mye er jenna jameson verdt

Noen få spesifikke mutasjoner funnet i den britiske stammen, som en som heter E484Q og en annen kalt N440K, har også blitt sett i noen andre varianter, og disse har sirkulert i den indiske befolkningen i flere måneder. For tiden er det ingen bevis som tyder på at noen av disse kan ha ført til den andre bølgen, eller forårsaket re-infeksjon hos pasienter.

Det kreves imidlertid mye mer detaljerte vitenskapelige undersøkelser for å vurdere deres innvirkning på spredningen av sykdommen i India.

Genomsekvensering...

India har det nest høyeste antallet personer som ble smittet av koronaviruset under epidemien. Men den har gjort svært få genomsekvenser av de forskjellige variantene i sirkulasjon. Så langt har den utført genanalyse av 19.092 prøver fra hele landet, ifølge en uttalelse fra regjeringen i Stortinget forrige uke. Dette inkluderer sekvensering av 10 787 prøver siden regjeringen opprettet INSACOG (Indian SARS-CoV2 Consortium on Genomics) i desember spesielt for dette formålet. Mange andre land, inkludert USA og Kina, har analysert mer enn 100 000 gensekvenser.

Å studere genetiske endringer i organismen er viktige ledetråder for å forstå opprinnelsen, overføringen og virkningen av viruset på pasienter. Det uttalte målet med INSACOG er å sekvensere prøvene fra minst 5 % av alle infiserte tilfeller gjennom et nettverk av ti laboratorier. Det ser ut som en veldig høy ordre akkurat nå. India har så langt registrert over 1,17 crore positive tilfeller. De 19 092 prøvene som har sekvensert til nå, utgjør bare 0,16 % av dette tallet.

BLI MED NÅ :Express Explained Telegram Channel

… og hvorfor det har gått tregt

sean belnick biografi

En av hovedårsakene til det langsomme tempoet i genomsekvensering har vært mangel på midler. Så langt har ingen penger blitt bevilget til INSACOG, selv om tjenestemenn sa at godkjenning for midler nå var forventet når som helst. Laboratoriene har brukt penger fra egne årlige budsjetter til å gjøre sekvenseringsarbeidet. Det tar mellom Rs 3000 og Rs 5000 for å trekke ut gensekvensen til en prøve. Kostnaden er hovedsakelig de kjemiske reagensene som kreves i prosessen.

Staten har heller ikke proaktivt sendt prøvene sine til laboratoriene for sekvensering. Maharashtra, som har registrert mer enn 25 lakh-infeksjoner til nå, har sendt bare rundt 2800 prøver for sekvensering, ifølge regjeringsdata presentert i parlamentet. Det er omtrent 0,11 % av alle tilfellene. Kerala har sendt det høyeste antallet prøver for sekvensering, omtrent 5200, men Karnataka, som har et sammenlignbart antall tilfeller, har sendt bare 137 prøver. En så lav grad av genomsekvensering er kanskje ikke statistisk signifikant for å trekke konklusjoner om den endrede naturen og oppførselen til viruset, eller for å utforme passende intervensjoner for å begrense spredningen av epidemien.

Denne artikkelen dukket først opp i den trykte utgaven 25. mars 2021 under tittelen 'Cracking the virus strain'.

Del Med Vennene Dine: